HL7 Czech DIGOVO Implementation Guide
0.0.1 - ci-build Czechia flag

HL7 Czech DIGOVO Implementation Guide, published by HL7 Czech Republic. This guide is not an authorized publication; it is the continuous build for version 0.0.1 built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) CI Build. This version is based on the current content of https://github.com/HL7-cz/DIGOVO/ and changes regularly. See the Directory of published versions

Artifacts

This page provides a list of the FHIR artifacts defined as part of this implementation guide.

Structures: Logical Models

These define data models that represent the domain covered by this implementation guide in more business-friendly terms than the underlying FHIR resources.

Anamnéza

Logický model pro sekci anamnézy v datasetu vzácných onemocnění.

Diagnóza vzácného onemocnění (cz)

Záznam diagnózy vzácného onemocnění včetně klasifikace, potvrzovací metody a genetických údajů.

Informace o subjektu - pacient

Logický model pro informace o subjektu - pacientovi v souladu s českými národními požadavky.

Informace o terapii pacienta

Logický model pro zachycení informací o terapii u pacientů, zejména při léčbě vzácných onemocnění. Obsahuje informace o léčivech, dávkování, dalších intervencích a způsobech léčby. V souladu s českými národními požadavky a standardem PZ.

Klinická trajektorie pacienta

Logický model pro zachycení informací o klinické trajektorii (care pathway) pacienta v rámci péče o vzácné onemocnění. Obsahuje informace o odesílajícím subjektu, datu přijetí do specializovaného centra, zapojených lékařích a klinických službách.

Prenatální a perinatální data

Logický model pro prenatální a perinatální údaje relevantní především u dětských pacientů.

Rodinní předkové ve vztahu k vzácnému onemocnění

Logický model pro záznam informací o rodinných předcích ve vztahu k vzácnému onemocnění.

Souhlas s opakovaným použitím dat (cz)

Záznam o souhlasu pacienta nebo zákonného zástupce s opakovaným použitím dat pacienta.

Stav života

Logický model pro záznam životního stavu pacienta ve vztahu k vzácnému onemocnění.

Užitečné informace o onemocnění a varování

Logický model pro zachycení doplňujících informací o onemocnění, doporučeních a hlavních varováních důležitých pro péči o pacienta. Součástí může být i pacientský souhrn.

Zdravotní péče poskytnutá pacientovi

Logický model pro zachycení údajů o zdravotní péči poskytnuté pacientovi, včetně typu intervence, účelu, zapojení do systémů jako CPMS, profese poskytovatelů a lokalizace centra péče. Vhodné primárně pro standardní dokumentaci; pro registry může být problematické kvůli variabilitě údajů.

Účast pacienta na výzkumu

Logický model pro zachycení údajů o účasti pacienta na výzkumu nebo studii včetně dostupnosti biologických vzorků a souhlasu s kontaktováním. Struktura odpovídá českým národním požadavkům a je v souladu s CDE.

Structures: Resource Profiles

These define constraints on FHIR resources for systems conforming to this implementation guide.

Composition (DIGOVO – klinický dokument o vzácném onemocnění)

Hlavní klinický dokument DIGOVO pro vzácná onemocnění. Zahrnuje sekce pro identifikaci pacienta, diagnózu, anamnézu, klinickou trajektorii, souhlas a další relevantní údaje.

Condition (Vzácné onemocnění – DIGOVO)

Diagnóza vzácného onemocnění s kódováním dle orphacode. Vazby na genetické a fenotypové důkazy jsou vedeny přes Condition.evidence.detail.

Consent (Souhlas s opakovaným použitím dat – DIGOVO)

Záznam o souhlasu pacienta nebo zákonného zástupce s opakovaným použitím dat pacienta. Používá se v rámci datasetu DIGOVO (část Souhlas).

Encounter (Odeslání pacienta – DIGOVO)

Záznam o odeslání nebo doporučení pacienta k dalšímu vyšetření či do specializovaného centra. Vztahuje se k části klinické trajektorie pacienta v DIGOVO.

Encounter (Přijetí do specializovaného centra – DIGOVO)

Záznam o přijetí pacienta do specializovaného centra péče o vzácná onemocnění. Součást klinické trajektorie pacienta v DIGOVO.

Observation (Biologická metoda – DIGOVO)

Záznam biologické nebo laboratorní metody použitý k potvrzení diagnózy vzácného onemocnění. Slouží jako podpůrný důkaz (Condition.evidence.detail), na který mohou odkazovat genotypové výsledky.

Observation (Dědičnost – DIGOVO)

Záznam o dědičnosti onemocnění (Yes / No / Unknown).

Observation (Fenotyp – DIGOVO)

Fenotypické projevy pacienta, vyjádřené pomocí terminologie HPO (Human Phenotype Ontology). Používá se jako podpůrný důkaz (Condition.evidence.detail) pro diagnózu vzácného onemocnění.

Observation (Genetická metoda – DIGOVO)

Záznam genetické testovací metody, například chromozomální, sekvenační, nebo NGS. Používá se pro popis konkrétního testu v rámci diagnostiky vzácného onemocnění.

Observation (Genotyp – DIGOVO)

Záznam genotypu pacienta ve vztahu ke vzácnému onemocnění. Používá se jako podkladový důkaz (Condition.evidence.detail) v rámci diagnózy vzácného onemocnění.

Observation (Klinické projevy – DIGOVO)

Záznam klinických fenotypových projevů pomocí HPO nebo SNOMED CT.

Observation (Nediagnostikovaný nález – DIGOVO)

Používá se v případech, kdy fenotypické nebo genetické rysy pacienta nelze zatím přiřadit ke konkrétní diagnóze. Slouží jako podklad pro evidenci nediagnostikovaných stavů (CDE-RD „Undiagnosed case“).

Observation (Postižení – DIGOVO)

Záznam funkčního nebo strukturálního postižení dle klasifikace ICF.

Observation (Věk při začátku potíží / diagnóze – DIGOVO)

Záznam o věku nebo datu, kdy začaly potíže spojené se vzácným onemocněním.

Procedure (Vyšetření – DIGOVO)

Záznam o vyšetření provedeném u pacienta v souvislosti se vzácným onemocněním. Vyšetření je modelováno jako FHIR Procedure a kódováno pomocí SNOMED CT. Používá se v sekci anamnézy (PatientHistory).

Structures: Extension Definitions

These define constraints on FHIR data types for systems conforming to this implementation guide.

Věk při stanovení diagnózy (DIGOVO)

Rozšíření pro uvedení věku pacienta v době stanovení diagnózy. Používá se v profilu CZ_ConditionRareDisease.

Terminology: Value Sets

These define sets of codes used by systems conforming to this implementation guide.

Biologické metody použité v diagnostice (DIGOVO)

Soubor metod biologické diagnostiky používaných při potvrzení diagnózy vzácného onemocnění. Převzato z logického modelu DIGOVO a harmonizováno s ERDRI Common Data Elements.

Fenotypické projevy (HPO)

Subset Human Phenotype Ontology (HPO) pro klinické projevy vzácných onemocnění. Používá se v rámci DIGOVO projektu.

Genetické testovací metody (DIGOVO)

Soubor genetických testovacích metod a přístupů používaných při diagnostice vzácných onemocnění. Zahrnuje klasifikaci Clinical, Genetic, Biochemical, Biological, Imaging, Functional Exploration, Pathological anatomy, Other.

HGVS kódování genetických variant (DIGOVO)

Soubor kódů pro popis genetických variant dle standardu HGVS (Human Genome Variation Society). Používá se v rámci profilu CZ_Observation_Genotype jako hodnota (valueCodeableConcept). Hodnoty odpovídají záznamům genetických variant, např. c.76A>T, p.Glu6Val. Zdrojem dat jsou HGVS zápisy, OMIM, ClinVar nebo interní registr variant.

ICF funkční postižení (CZ)

Subset klasifikace ICF dle WHO.

Souhlas s opakovaným použitím dat (Yes/No)

Hodnoty určující, zda byl udělen souhlas s opakovaným použitím dat pacienta.

Typ vzácného onemocnění (DIGOVO)

Typ vzácného onemocnění — zda je onemocnění sporadické nebo familiární. Používá se v rozšíření Condition.extension:typOnemocneni.

ValueSet – orphaCode (CZ)

ValueSet pro kódování diagnóz vzácných onemocnění dle orphanet (orphacode). Používá se v rámci IG DIGOVO pro Condition nebo Observation.

Závažnost vzácného onemocnění – DIGOVO

Kategorie závažnosti pro diagnózy vzácných onemocnění, kompatibilní s ERDRI a SNOMED CT.

Terminology: Code Systems

These define new code systems used by systems conforming to this implementation guide.

Biologické metody použité v diagnostice (DIGOVO)

Číselník biologických metod používaných při diagnostice vzácných onemocnění. Vyjadřuje, jakým způsobem byla provedena biologická nebo laboratorní analýza, která vedla ke zjištění genotypu nebo potvrzení diagnózy.

Genetické a diagnostické metody (DIGOVO)

Číselník metod použitých pro potvrzení diagnózy vzácného onemocnění. Zahrnuje klinické, genetické, biochemické a zobrazovací metody. Vybráno podle logického modelu DIGOVO a harmonizováno s ERDRI Common Data Elements.

Typ vzácného onemocnění (DIGOVO)

Číselník pro určení, zda je vzácné onemocnění sporadické nebo familiární. Používá se v rozšíření Condition.extension:typOnemocneni.

Terminology: Concept Maps

These define transformations to convert between codes by systems conforming with this implementation guide.

DIGOVO Consent Reuse Data Logical Model → FHIR Mapping

Mapování logického modelu DIGOVO 'Souhlas s opakovaným použitím dat' na FHIR profil CZ_Consent_ReuseData.

DIGOVO PatientHistory Logical Model → FHIR Mapping

Mapování logického modelu DIGOVO 'Anamnéza pacienta (LogCzPatientHistory)' na konkrétní FHIR profily CZ DIGOVO.

DIGOVO Subject Model to CZ Core Patient Map

Mapování logického modelu DIGOVO 'Informace o subjektu - pacient' na FHIR Patient podle českého národního profilu CZ Core Patient.

LogCzRareDiseaseDiagnosis → CZ_ConditionRareDisease + CZ_Observation_* (DIGOVO)

DIGOVO FHIR mapování na profily profily: CZ_ConditionRareDisease, CZ_Observation_Genotype, CZ_Observation_Phenotype, CZ_Observation_BiologicalMethod, CZ_Observation_GeneticTest, CZ_Observation_UndiagnosedFinding.