HL7 Czech DIGOVO Implementation Guide
0.0.1 - ci-build Czechia flag

HL7 Czech DIGOVO Implementation Guide, published by HL7 Czech Republic. This guide is not an authorized publication; it is the continuous build for version 0.0.1 built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) CI Build. This version is based on the current content of https://github.com/HL7-cz/DIGOVO/ and changes regularly. See the Directory of published versions

Logical Model: LogCzRareDiseaseDiagnosis - Detailed Descriptions

Draft as of 2025-11-08

Definitions for the LogRareDiseaseDiagnosisCz logical model.

Guidance on how to interpret the contents of this table can be foundhere

0. LogRareDiseaseDiagnosisCz
Definition

Záznam diagnózy vzácného onemocnění včetně klasifikace, potvrzovací metody a genetických údajů.

ShortDiagnóza vzácného onemocnění (cz)
Control0..*
Is Modifierfalse
Logical ModelInstances of this logical model are not marked to be the target of a Reference
2. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni
Definition

Diagnóza, pro kterou je pacient registrován u zadávajícího pracoviště. Pokud má pacient více vzácných onemocnění, lze na stejná administrativní data navázat více formulářů.

ShortDiagnóza vzácného onemocnění
Control1..*
TypeBase
4. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nazev
Definition

Diagnóza dle orphacode. Může být uvedeno více hodnot, pokud se vztahují k více diagnózám. Included in CDE: Yes.

ShortNázev onemocnění (diagnózy)
Control1..1
Binding

Použít kódování dle orphacode

TypeCodeableConcept
6. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.aktualniStav
Definition

Stav diagnózy – Ongoing, Likely, Confirmed nebo Unknown.

ShortAktuální stav diagnózy
Control0..1
TypeCodeableConcept
8. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.metodaPotvrzeni
Definition

Způsob potvrzení diagnózy: Clinical, Genetic, Biochemical, Biological, Imaging, Functional Exploration, Pathological anatomy, Other. (dotaz na autory: definovat rozdíl mezi 'biochemical' a 'biological').

ShortMetoda potvrzení diagnózy
Control0..*
TypeCodeableConcept
10. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.biologickaMetoda
Definition

Metoda biologické diagnostiky: Chromosomal, APCA, Targeted Sequencing, New Generation Sequencing, Other, N/A.

ShortBiologická metoda použitá v diagnostice
Control0..*
TypeCodeableConcept
12. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.gen
Definition

Kód genu dle HGNC. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného vzácného onemocnění.

ShortGen a mutace (pokud lze použít)
Control0..1
Binding

Použít kódování HGNC

TypeCodeableConcept
14. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.genovaVarianta
Definition

Kód genetické varianty dle HGVS. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného onemocnění.

ShortGenová varianta (je-li relevantní)
Control0..1
Binding

Použít kódování HGVS

TypeCodeableConcept
16. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.typOnemocneni
Definition

Označuje, zda je onemocnění sporadické nebo familiární. Možno použít i u onemocnění, kde není gen definován.

ShortSporadické nebo familiární onemocnění
Control0..1
TypeCodeableConcept
18. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane
Definition

Používá se, pokud nelze onemocnění klasifikovat konkrétní diagnózou. Termín podle CDE.

ShortNediagnostikované (undiagnosed) onemocnění
Control0..*
TypeBackboneElement
Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
20. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.id
Definition

Unique id for the element within a resource (for internal references). This may be any string value that does not contain spaces.

ShortUnique id for inter-element referencing
Control0..1
Typestring
Is Modifierfalse
XML FormatIn the XML format, this property is represented as an attribute.
Summaryfalse
22. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.extension
Definition

May be used to represent additional information that is not part of the basic definition of the element. To make the use of extensions safe and manageable, there is a strict set of governance applied to the definition and use of extensions. Though any implementer can define an extension, there is a set of requirements that SHALL be met as part of the definition of the extension.

ShortAdditional content defined by implementations
Comments

There can be no stigma associated with the use of extensions by any application, project, or standard - regardless of the institution or jurisdiction that uses or defines the extensions. The use of extensions is what allows the FHIR specification to retain a core level of simplicity for everyone.

Control0..*
TypeExtension
Is Modifierfalse
Summaryfalse
Alternate Namesextensions, user content
Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
ext-1: Must have either extensions or value[x], not both (extension.exists() != value.exists())
SlicingThis element introduces a set of slices on LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.extension. The slices areUnordered and Open, and can be differentiated using the following discriminators:
  • value @ url
  • 24. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.modifierExtension
    Definition

    May be used to represent additional information that is not part of the basic definition of the element and that modifies the understanding of the element in which it is contained and/or the understanding of the containing element's descendants. Usually modifier elements provide negation or qualification. To make the use of extensions safe and manageable, there is a strict set of governance applied to the definition and use of extensions. Though any implementer can define an extension, there is a set of requirements that SHALL be met as part of the definition of the extension. Applications processing a resource are required to check for modifier extensions.

    Modifier extensions SHALL NOT change the meaning of any elements on Resource or DomainResource (including cannot change the meaning of modifierExtension itself).

    ShortExtensions that cannot be ignored even if unrecognized
    Comments

    There can be no stigma associated with the use of extensions by any application, project, or standard - regardless of the institution or jurisdiction that uses or defines the extensions. The use of extensions is what allows the FHIR specification to retain a core level of simplicity for everyone.

    Control0..*
    TypeExtension
    Is Modifiertrue because Modifier extensions are expected to modify the meaning or interpretation of the element that contains them
    Summarytrue
    Requirements

    Modifier extensions allow for extensions that cannot be safely ignored to be clearly distinguished from the vast majority of extensions which can be safely ignored. This promotes interoperability by eliminating the need for implementers to prohibit the presence of extensions. For further information, see the definition of modifier extensions.

    Alternate Namesextensions, user content, modifiers
    Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
    ext-1: Must have either extensions or value[x], not both (extension.exists() != value.exists())
    26. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.fenotyp
    Definition

    Fenotypické projevy dle HPO.

    ShortFenotyp
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    28. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.genotyp
    Definition

    Genotyp dle HGVS.

    ShortGenotyp
    Control0..*
    TypeCodeableConcept

    Guidance on how to interpret the contents of this table can be foundhere

    0. LogRareDiseaseDiagnosisCz
    Definition

    Záznam diagnózy vzácného onemocnění včetně klasifikace, potvrzovací metody a genetických údajů.

    ShortDiagnóza vzácného onemocnění (cz)
    Logical ModelInstances of this logical model are not marked to be the target of a Reference
    2. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni
    Definition

    Diagnóza, pro kterou je pacient registrován u zadávajícího pracoviště. Pokud má pacient více vzácných onemocnění, lze na stejná administrativní data navázat více formulářů.

    ShortDiagnóza vzácného onemocnění
    Control1..*
    TypeBase
    4. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nazev
    Definition

    Diagnóza dle orphacode. Může být uvedeno více hodnot, pokud se vztahují k více diagnózám. Included in CDE: Yes.

    ShortNázev onemocnění (diagnózy)
    Control1..1
    Binding

    Použít kódování dle orphacode

    TypeCodeableConcept
    6. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.aktualniStav
    Definition

    Stav diagnózy – Ongoing, Likely, Confirmed nebo Unknown.

    ShortAktuální stav diagnózy
    Control0..1
    TypeCodeableConcept
    8. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.metodaPotvrzeni
    Definition

    Způsob potvrzení diagnózy: Clinical, Genetic, Biochemical, Biological, Imaging, Functional Exploration, Pathological anatomy, Other. (dotaz na autory: definovat rozdíl mezi 'biochemical' a 'biological').

    ShortMetoda potvrzení diagnózy
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    10. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.biologickaMetoda
    Definition

    Metoda biologické diagnostiky: Chromosomal, APCA, Targeted Sequencing, New Generation Sequencing, Other, N/A.

    ShortBiologická metoda použitá v diagnostice
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    12. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.gen
    Definition

    Kód genu dle HGNC. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného vzácného onemocnění.

    ShortGen a mutace (pokud lze použít)
    Control0..1
    Binding

    Použít kódování HGNC

    TypeCodeableConcept
    14. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.genovaVarianta
    Definition

    Kód genetické varianty dle HGVS. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného onemocnění.

    ShortGenová varianta (je-li relevantní)
    Control0..1
    Binding

    Použít kódování HGVS

    TypeCodeableConcept
    16. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.typOnemocneni
    Definition

    Označuje, zda je onemocnění sporadické nebo familiární. Možno použít i u onemocnění, kde není gen definován.

    ShortSporadické nebo familiární onemocnění
    Control0..1
    TypeCodeableConcept
    18. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane
    Definition

    Používá se, pokud nelze onemocnění klasifikovat konkrétní diagnózou. Termín podle CDE.

    ShortNediagnostikované (undiagnosed) onemocnění
    Control0..*
    TypeBackboneElement
    20. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.fenotyp
    Definition

    Fenotypické projevy dle HPO.

    ShortFenotyp
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    22. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.genotyp
    Definition

    Genotyp dle HGVS.

    ShortGenotyp
    Control0..*
    TypeCodeableConcept

    Guidance on how to interpret the contents of this table can be foundhere

    0. LogRareDiseaseDiagnosisCz
    Definition

    Záznam diagnózy vzácného onemocnění včetně klasifikace, potvrzovací metody a genetických údajů.

    ShortDiagnóza vzácného onemocnění (cz)
    Control0..*
    Is Modifierfalse
    Logical ModelInstances of this logical model are not marked to be the target of a Reference
    2. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni
    Definition

    Diagnóza, pro kterou je pacient registrován u zadávajícího pracoviště. Pokud má pacient více vzácných onemocnění, lze na stejná administrativní data navázat více formulářů.

    ShortDiagnóza vzácného onemocnění
    Control1..*
    TypeBase
    4. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nazev
    Definition

    Diagnóza dle orphacode. Může být uvedeno více hodnot, pokud se vztahují k více diagnózám. Included in CDE: Yes.

    ShortNázev onemocnění (diagnózy)
    Control1..1
    Binding

    Použít kódování dle orphacode

    TypeCodeableConcept
    6. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.aktualniStav
    Definition

    Stav diagnózy – Ongoing, Likely, Confirmed nebo Unknown.

    ShortAktuální stav diagnózy
    Control0..1
    TypeCodeableConcept
    8. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.metodaPotvrzeni
    Definition

    Způsob potvrzení diagnózy: Clinical, Genetic, Biochemical, Biological, Imaging, Functional Exploration, Pathological anatomy, Other. (dotaz na autory: definovat rozdíl mezi 'biochemical' a 'biological').

    ShortMetoda potvrzení diagnózy
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    10. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.biologickaMetoda
    Definition

    Metoda biologické diagnostiky: Chromosomal, APCA, Targeted Sequencing, New Generation Sequencing, Other, N/A.

    ShortBiologická metoda použitá v diagnostice
    Control0..*
    TypeCodeableConcept
    12. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.gen
    Definition

    Kód genu dle HGNC. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného vzácného onemocnění.

    ShortGen a mutace (pokud lze použít)
    Control0..1
    Binding

    Použít kódování HGNC

    TypeCodeableConcept
    14. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.genovaVarianta
    Definition

    Kód genetické varianty dle HGVS. Vyplňuje se pouze u geneticky podmíněného onemocnění.

    ShortGenová varianta (je-li relevantní)
    Control0..1
    Binding

    Použít kódování HGVS

    TypeCodeableConcept
    16. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.typOnemocneni
    Definition

    Označuje, zda je onemocnění sporadické nebo familiární. Možno použít i u onemocnění, kde není gen definován.

    ShortSporadické nebo familiární onemocnění
    Control0..1
    TypeCodeableConcept
    18. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane
    Definition

    Používá se, pokud nelze onemocnění klasifikovat konkrétní diagnózou. Termín podle CDE.

    ShortNediagnostikované (undiagnosed) onemocnění
    Control0..*
    TypeBackboneElement
    Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
    20. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.id
    Definition

    Unique id for the element within a resource (for internal references). This may be any string value that does not contain spaces.

    ShortUnique id for inter-element referencing
    Control0..1
    Typestring
    Is Modifierfalse
    XML FormatIn the XML format, this property is represented as an attribute.
    Summaryfalse
    22. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.extension
    Definition

    May be used to represent additional information that is not part of the basic definition of the element. To make the use of extensions safe and manageable, there is a strict set of governance applied to the definition and use of extensions. Though any implementer can define an extension, there is a set of requirements that SHALL be met as part of the definition of the extension.

    ShortAdditional content defined by implementations
    Comments

    There can be no stigma associated with the use of extensions by any application, project, or standard - regardless of the institution or jurisdiction that uses or defines the extensions. The use of extensions is what allows the FHIR specification to retain a core level of simplicity for everyone.

    Control0..*
    TypeExtension
    Is Modifierfalse
    Summaryfalse
    Alternate Namesextensions, user content
    Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
    ext-1: Must have either extensions or value[x], not both (extension.exists() != value.exists())
    SlicingThis element introduces a set of slices on LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.extension. The slices areUnordered and Open, and can be differentiated using the following discriminators:
    • value @ url
    • 24. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.modifierExtension
      Definition

      May be used to represent additional information that is not part of the basic definition of the element and that modifies the understanding of the element in which it is contained and/or the understanding of the containing element's descendants. Usually modifier elements provide negation or qualification. To make the use of extensions safe and manageable, there is a strict set of governance applied to the definition and use of extensions. Though any implementer can define an extension, there is a set of requirements that SHALL be met as part of the definition of the extension. Applications processing a resource are required to check for modifier extensions.

      Modifier extensions SHALL NOT change the meaning of any elements on Resource or DomainResource (including cannot change the meaning of modifierExtension itself).

      ShortExtensions that cannot be ignored even if unrecognized
      Comments

      There can be no stigma associated with the use of extensions by any application, project, or standard - regardless of the institution or jurisdiction that uses or defines the extensions. The use of extensions is what allows the FHIR specification to retain a core level of simplicity for everyone.

      Control0..*
      TypeExtension
      Is Modifiertrue because Modifier extensions are expected to modify the meaning or interpretation of the element that contains them
      Summarytrue
      Requirements

      Modifier extensions allow for extensions that cannot be safely ignored to be clearly distinguished from the vast majority of extensions which can be safely ignored. This promotes interoperability by eliminating the need for implementers to prohibit the presence of extensions. For further information, see the definition of modifier extensions.

      Alternate Namesextensions, user content, modifiers
      Invariantsele-1: All FHIR elements must have a @value or children (hasValue() or (children().count() > id.count()))
      ext-1: Must have either extensions or value[x], not both (extension.exists() != value.exists())
      26. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.fenotyp
      Definition

      Fenotypické projevy dle HPO.

      ShortFenotyp
      Control0..*
      TypeCodeableConcept
      28. LogRareDiseaseDiagnosisCz.diagnozaVzacnehoOnemocneni.nediagnostikovane.genotyp
      Definition

      Genotyp dle HGVS.

      ShortGenotyp
      Control0..*
      TypeCodeableConcept