HL7 Czech Lab Epidemiology Guide
0.0.1 - ci-build

HL7 Czech Lab Epidemiology Guide, published by HL7 Czech Republic. This guide is not an authorized publication; it is the continuous build for version 0.0.1 built by the FHIR (HL7® FHIR® Standard) CI Build. This version is based on the current content of https://github.com/HL7-cz/lab-epi/ and changes regularly. See the Directory of published versions

## Background

## Popis situace

Monitoring infekčních onemocnění v populaci je zásadní pro ochranu veřejného zdraví a pro přijímání opatření, která mohou šíření infekcí zpomalit nebo mu zabránit. Umožňuje rovněž sledovat a předvídat vývoj epidemií a plánovat potřebné kapacity zdravotnického systému.

V případě epidemie je klíčové nastavit systém včasného varování, který umožní rychlou reakci na vznikající zdravotní rizika. Takový systém vyžaduje plnou elektronizaci hlášení a přímé napojení na informační systémy poskytovatelů zdravotní péče, kteří budou v reálném čase zasílat údaje o výskytu infekčních onemocnění.

Jedním ze tří hlavních pilířů tohoto systému je hlášení z laboratorních pracovišť, které zajišťuje průkaz infekčního onemocnění. Zapojenými subjekty jsou mikrobiologické laboratoře, které potvrzují nebo specifikují původce infekce, včetně jeho citlivosti na antibiotika.

Dalšími částmi systému jsou hlášení od nemocničních a ambulantních poskytovatelů zdravotních služeb, které jsou popsány v samostatných dokumentech.

### Obchodní požadavky

Cílem je definovat datové rozhraní ve formátu HL7 FHIR pro automatizované hlášení výsledků mikrobiologických vyšetření z laboratorních informačních systémů do centrální databáze ISIN, čímž se podpoří datové sběry v rámci projektu SCOPE-IS.

Navrhované řešení navazuje na úspěšnou elektronizaci zasílání laboratorních výsledků během pandemie COVID-19. Sběr dat má probíhat v reálném čase, ihned po vyhodnocení laboratorního výsledku, aby systém fungoval jako early warning systém — tedy umožnil včasné informování příslušných orgánů o výskytu infekčních onemocnění.

Tento systém doplňuje další sběry dat v projektu SCOPE-IS, které budou probíhat u praktických lékařů a nemocničních zařízení.

### Projekt SCOPE-IS

Projekt SCOPE-IS má za cíl vytvořit systém včasného varování (Early Warning System) pro vybrané infekční nemoci v České republice, jako součást elektronického Informačního systému infekčních nemocí (ISIN).

Projekt umožní efektivní zadávání a aktualizaci údajů o pacientech s infekčními onemocněními a propojí laboratorní data s daty od ambulantních a nemocničních poskytovatelů. Cílem je vytvořit robustní systém pro sledování a predikci výskytu infekčních onemocnění.